Eu também acho que se fosse relé piscavam ambas rápido, suponho que estejam ligadas ao mesmo.. Se a energia não chega a uma, imagina, por um fusível fundido como dizes, é normal que a outra pisque mais rápido e esta esteja apagada....
Mas atenção que eu não percebo nada de electrónica, nem sei que fusíveis (ou tudo o mais) existem no circuito dos piscas... Mas pelo comportamento e lógica suponho que seja um ponto qualquer que não deixa a energia passar para uma das lâmpadas, fusível, fio com mau contacto, etc....
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